中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心于2016年3月正式組建成立。為了將生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)面向國家及社會的工程化服務(wù)與面向科學(xué)技術(shù)前沿的創(chuàng)新研究有機(jī)結(jié)合，中心依托上海生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)工程技術(shù)研究中心，組建了由研究員、工程師、博士后構(gòu)成的青年創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，投入面向生物醫(yī)學(xué)創(chuàng)新發(fā)展的生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)建設(shè)工作，積極推進(jìn)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)在人群隊(duì)列、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、表型組、微生物學(xué)等方面的數(shù)據(jù)體系、分析體系和應(yīng)用體系的建設(shè)。
研究所與團(tuán)隊(duì)簡介
中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所（以下簡稱“營養(yǎng)與健康所”）系根據(jù)中國科學(xué)院深化上海生命科學(xué)研究院改革決策部署，于2016年底整合組建的獨(dú)立事業(yè)法人研究機(jī)構(gòu)。營養(yǎng)與健康所面向人民生命健康，圍繞“健康中國”戰(zhàn)略、積極應(yīng)對人口老齡化國家戰(zhàn)略，聚焦“重大慢病防控與老齡健康促進(jìn)”科技戰(zhàn)略重點(diǎn)，打造國際知名的健康科學(xué)與技術(shù)機(jī)構(gòu)、科技智庫和健康產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心。
營養(yǎng)與健康所“十四五”期間生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)重大科技任務(wù)團(tuán)隊(duì)由張國慶研究員、王澤峰研究員、李海鵬研究員、高瑩研究員、黃濤青年研究員五個(gè)研究組聯(lián)合組建而成，張國慶任重大科技任務(wù)首席科學(xué)家，并邀請趙國屏院士、李亦學(xué)研究員等資深專家作為團(tuán)隊(duì)指導(dǎo)專家。團(tuán)隊(duì)擁有10PB級別的生命組學(xué)數(shù)據(jù)資源和文獻(xiàn)資源，30 PB存儲、250臺高性能服務(wù)器（其中TB級超大內(nèi)存服務(wù)器15臺）集群組成的計(jì)算資源一體化環(huán)境，通過https://www.biosino.org/ 提供對外服務(wù)。團(tuán)隊(duì)研究成果發(fā)表在Cell、Cell Research、Mol Cell、Cancer Cell、Nature Microbiology、Nature Methods、Nature Communications、Nucleic Acids Research、National Science Review、Briefings in Bioinformatics、Science Bulletin、American Journal of Clinical Nutrition等國際學(xué)術(shù)期刊。
研究內(nèi)容：生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)重大科技任務(wù)團(tuán)隊(duì)聚焦生命組學(xué)與健康醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的知識發(fā)現(xiàn)過程中的核心技術(shù)，圍繞核心數(shù)據(jù)資源匯聚、多模態(tài)數(shù)據(jù)管理、多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析、健康醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)治理、知識圖譜構(gòu)建等技術(shù)問題，開展系統(tǒng)生物學(xué)算法/軟件/流程研發(fā)、人群隊(duì)列/腫瘤等復(fù)雜慢性疾病知識發(fā)現(xiàn)研究，并推動(dòng)在人口健康和臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用。
研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)目前的發(fā)展需要，現(xiàn)面向國內(nèi)外招聘生物信息學(xué)研究方向的副研究員或助理研究員和博士后2名，數(shù)據(jù)科學(xué)研究方向的副研究員或助理研究員和博士后2名，誠摯邀請具有相關(guān)學(xué)科背景的優(yōu)秀青年學(xué)者加入。
一、研究方向
應(yīng)聘者任選一研究方向即可。
研究方向1：醫(yī)學(xué)信息的自然語言處理、數(shù)據(jù)治理和知識圖譜等關(guān)鍵技術(shù)的研究與應(yīng)用。
研究方向2：生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的自然語言處理、知識圖譜和海量數(shù)據(jù)可視化。
研究方向3：多組學(xué)數(shù)據(jù)分析及其在臨床及基礎(chǔ)研究中的應(yīng)用。
研究方向4：時(shí)空轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用。
二、應(yīng)聘要求：
1. 具有生物信息學(xué)、生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)治理、知識圖譜、人工智能、流行病學(xué)等相關(guān)科研經(jīng)驗(yàn)；副研究員或助理研究員要求有至少2年博士后工作經(jīng)歷;博士后要求獲得博士學(xué)位時(shí)間不超過3年。
2. 應(yīng)聘博士后人員應(yīng)屆博士畢業(yè)生優(yōu)先；以第一作者（含并列）在領(lǐng)域核心學(xué)術(shù)期刊、會議發(fā)表過研究論文者優(yōu)先，或取得研究相關(guān)的專利的主要發(fā)明人優(yōu)先。
3. 本人有強(qiáng)烈科研意愿，希望能夠做出重要原創(chuàng)性技術(shù)突破。具備獨(dú)立開展科研工作能力，具有良好團(tuán)隊(duì)合作精神、良好的溝通交流能力及較強(qiáng)的中英文交流寫作能力。
三、福利待遇
1. 按照營養(yǎng)與健康所的規(guī)定，提供極具競爭力的薪酬待遇及良好的個(gè)人職業(yè)發(fā)展平臺，積極支持其崗位晉升和待遇提升。
2. 享受上海市相關(guān)社會保險(xiǎn)、住房公積金等待遇，根據(jù)國家及上海市相關(guān)政策協(xié)助辦理人才落戶等。
3. 大力支持申報(bào)國家及上海市各類基金項(xiàng)目，以及中科院特別研究助理資助項(xiàng)目、青促會項(xiàng)目、中科院引才計(jì)劃等項(xiàng)目。
4. 支持參加高水平國內(nèi)外會議。博士后入站后將納入中科院特別研究助理崗位管理。
四、招聘方式及程序
1. 報(bào)名截止時(shí)間
長期有效，招滿為止。
2. 應(yīng)聘者須提供以下應(yīng)聘材料
（1）個(gè)人簡歷（教育經(jīng)歷、工作經(jīng)歷、發(fā)表論文、榮譽(yù)獎(jiǎng)勵(lì)等）；
?。?）有關(guān)證明材料：身份證、學(xué)歷及學(xué)位證書（學(xué)歷學(xué)位必須在學(xué)信網(wǎng)可查詢驗(yàn)證）、相關(guān)資格證書、獲獎(jiǎng)證書等；
?。?）第一作者/共同第一作者的論文全文以及其他應(yīng)聘者認(rèn)為重要的書面材料。
五、聯(lián)系方式
有意向者，請將上述材料的電子版發(fā)至lujian@picb.ac.cn（請?jiān)趹?yīng)聘材料和郵件主題欄注明應(yīng)聘崗位和姓名，按如下格式：“姓名－應(yīng)聘崗位”）。初審合格后，我們將盡快通知面試，擇優(yōu)錄用。謝絕來電來訪，應(yīng)聘材料恕不退還，本單位將予以保密。
團(tuán)隊(duì)科學(xué)家簡介
趙國屏院士，分子微生物學(xué)家，中國科學(xué)院院士，第三世界科學(xué)院院士，美國微生物科學(xué)院院士。多年從事微生物生理生化、代謝調(diào)控及酶作用機(jī)理的研究。參與組織中國人類基因組計(jì)劃，建立基因組學(xué)研究平臺；啟動(dòng)生物芯片、生物信息學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)研究工作。在微生物基因組、代謝酶乙酰化組、腸道微生物組研究方面，做出開創(chuàng)性工作。開拓系統(tǒng)合成生物學(xué)研究領(lǐng)域，在天然化合物人工細(xì)胞工廠合成、單染色體酵母構(gòu)建與CRISPR-Dx體系創(chuàng)建方面作出基礎(chǔ)性貢獻(xiàn)。
李亦學(xué)研究員，生物信息學(xué)專家。長期致力于生物信息學(xué)理論創(chuàng)新與應(yīng)用，取得開拓和系統(tǒng)性成果。在計(jì)算生物學(xué)理論方法與生命組學(xué)的融合方面，基于群體遺傳和進(jìn)化原理，建立錨定蘊(yùn)含關(guān)鍵遺傳信息的“Sweep”區(qū)域新計(jì)算模型，開展SARS、狼、狗、駱駝、蝎子和新冠病毒的比較和功能基因組研究，相關(guān)工作發(fā)表在Genome，Res. Mol. Biol. Evol.，Nature Comm.，Bioinformatics、Mol. Sys. Biol.，Nucle. Acids Res.，Oncogene等雜志，被Nature和Science雜志頭版報(bào)道評述，獲2020年中國十大生物信息學(xué)研究進(jìn)展。在計(jì)算生物學(xué)理論方法與基因編輯技術(shù)的融合方面，建立不依賴基因編輯技術(shù)體系和編輯位點(diǎn)特殊性深度學(xué)習(xí)算法，相關(guān)工作發(fā)表在Science，Nature，Nature Method，Cell Stem Cell， Nature Rev Gastro&Hepat，Nature Sci. Rev.等雜志，獲2019年“中國生命科學(xué)十大進(jìn)展”。詳細(xì)情況介紹請參考http://athena-shower.com/rcdw/kzyjy/201803/t20180327_4986743.html。
張國慶研究員，從事生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)管理體系與知識圖譜研究，中國遺傳學(xué)會生物大數(shù)據(jù)專業(yè)委員會委員，中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會生物醫(yī)學(xué)信息技術(shù)分會委員。相關(guān)研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、基金委國家重大科研儀器研制項(xiàng)目（部門推薦）、中國科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)（B 類）、上海市市級科技重大專項(xiàng)等國家和上海市的重大重點(diǎn)項(xiàng)目資助。詳細(xì)情況介紹請參考http://athena-shower.com/rcdw/qtbssds/202203/t20220311_6388137.html ；近期研究論文詳見 https://orcid.org/0000-0001-8827-7546 。
王澤峰研究員，中科院計(jì)算生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任。長期從事RNA系統(tǒng)生物學(xué)研究及相關(guān)技術(shù)研發(fā)，包括RNA可變剪接的調(diào)控；環(huán)形RNA的非典型翻譯及其生理功能；設(shè)計(jì)人工RNA結(jié)合蛋白質(zhì)來操控RNA。2014年在國際上首次發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNA可進(jìn)行翻譯來合成蛋白，并系統(tǒng)性鑒定了非典型RNA翻譯調(diào)控元件，開創(chuàng)了環(huán)形RNA作為新一代mRNA療法的應(yīng)用。于Cell，Mol Cell, Cancer Cell, Nat Struct Mol Biol, Cell Research, Nat Methods, Nature Communications, PNAS, eLife等核心雜志發(fā)表論文70余篇并被廣泛引用。獲多項(xiàng)國際國內(nèi)獎(jiǎng)勵(lì)。受邀任科學(xué)通報(bào)，JMCB，BBA advance副主編和多個(gè)學(xué)術(shù)期刊編委。詳細(xì)情況介紹請參考http://athena-shower.com/rcdw/qtyjzz/201803/t20180327_4986754.html。
李海鵬研究員，長期致力于發(fā)展進(jìn)化理論，解決關(guān)鍵生物學(xué)問題，發(fā)表SCI論文60余篇。為中國營養(yǎng)學(xué)會營養(yǎng)與組學(xué)技術(shù)分會副主任委員、上海市生物物理學(xué)會理事、中國遺傳學(xué)會終身會員及多個(gè)期刊編委。主要學(xué)術(shù)貢獻(xiàn)為：創(chuàng)建采用全基因組數(shù)據(jù)估計(jì)群體進(jìn)化歷史后再檢測正選擇的校準(zhǔn)型經(jīng)典方法體系；揭示祖先群體可能比衍生群體更加遠(yuǎn)離外群，糾正教科書中一個(gè)重要錯(cuò)誤；創(chuàng)建從非平衡溯祖樹檢測正選擇的理論體系，提高檢測精確度；將人工智能引入群體遺傳學(xué)，成功檢測正選擇，并建立迄今為止最為精確的人類遺傳重組圖譜；創(chuàng)建用聯(lián)合突變頻譜估計(jì)多群體進(jìn)化歷史的新方法；圍繞中科院先導(dǎo)任務(wù)組隊(duì)進(jìn)行攻關(guān)，開發(fā)綜合分析免費(fèi)軟件eGPS，助力大數(shù)據(jù)深度挖掘；發(fā)展正選擇檢測新方法，精準(zhǔn)定位非編碼區(qū)的社會增強(qiáng)子PAS1，揭示PAS1-Lhx2對羊膜動(dòng)物社會階層形成的關(guān)鍵作用，并且突變PAS1可反轉(zhuǎn)社會階層，揭示社會階層如何通過演化出現(xiàn)；創(chuàng)立快速極小時(shí)間溯祖新理論，首次獲得任意群體模型下突變頻率頻譜的解析解，發(fā)現(xiàn)90萬年前舊石器時(shí)代人類曾面臨滅絕的威脅，解釋非洲人類化石的重要缺失環(huán)節(jié)。詳細(xì)情況介紹請參考http://athena-shower.com/rcdw/qtyjzz/201803/t20180327_4986742.html。
高瑩研究員，研究方向?yàn)闋I養(yǎng)分子流行病學(xué)，目前主要研究脂肪酸攝入和代謝在代謝紊亂、癌癥和生長發(fā)育中的作用；尋找可以和營養(yǎng)因素共同影響疾病危險(xiǎn)性的表觀遺傳因素以第一作者和通訊作者身份在Gastroenterology, International Journal of Cancer, American Journal of Clinical Nutrition, Journal of Nutrition, British Journal of Nutrition 等期刊發(fā)表SCI論文30余篇；擔(dān)任Journal of Nutritional Biochemistry 編輯。詳細(xì)情況介紹請參考http://athena-shower.com/rcdw/qtyjzz/201803/t20180328_4987324.html 。
黃濤青年研究員，研究方向?yàn)樯镝t(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)和網(wǎng)絡(luò)分析。曾在美國紐約西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院從事博士后研究。目前擔(dān)任中國科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會生命分會副會長。發(fā)表論文100余篇，累計(jì)引用超過1萬次，連續(xù)多年入選Elsevier中國高被引學(xué)者和全球前2%頂尖科學(xué)家榜單。主持或參與國家自然科學(xué)基金委項(xiàng)目、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國科學(xué)院先導(dǎo)科技專項(xiàng)、上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目、國際人類表型組計(jì)劃等國家及省部級研究項(xiàng)目10余項(xiàng)。詳細(xì)情況介紹請參考http://athena-shower.com/rcdw/qtbssds/202203/t20220310_6387862.html ；近期研究論文詳見 https://scholar.google.com.hk/citations?hl=en&user=N6meTgoAAAAJ 。
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